Η Μεσσούνη ή Μεσούνη είναι πεδινό χωριό της Θράκης στην Περιφερειακή Ενότητα Ροδόπης.
Η Μεσσούνη βρίσκεται στην πεδιάδα της Κομοτηνής σε υψόμετρο 40 μέτρα και σε απόσταση 11 χλμ. νοτιοδυτικά από το κέντρο της πόλης. Το χωριό χαρακτηρίζεται ως προσφυγικό αφού μετά την την συνθήκη του Νεϊγύ (1919) και την ανταλλαγή πληθυσμών εγκαταστάθηκαν τελικά πρόσφυγες από το Σαναπλί της Ανατολικής Ρωμυλίας. Οι Βούλγαροι κάτοικοί του μετακινήθηκαν ενώ το 1955 έφυγαν και οι Μουσουλμάνοι κάτω από αδιευκρίνιστες συνθήκες. Στις αρχές κάθε φθινοπώρου ο Μορφωτικός Πολιτιστικός Σύλλογος του χωριού αναβιώνει το παραδοσιακό έθιμο της "Σιντιάνκας", κατά το οποίο ανάβεται πυρά, ενώ οι παρευρισκόμενοι χορεύουν και τραγουδούν παραδοσιακά τραγούδια. Η λέξη σιντιάνκα σημαίνει "συνάντηση", ενώ το δρώμενο προέρχεται από την Ανατολική Ρωμυλία. Ως οικισμός αναφέρεται επίσημα, μετά την απελευθέρωση, το 1924 στο ΦΕΚ 194Α - 14/08/1924 να προσαρτάται στην τότε κοινότητα Αμβροσίας. Σύμφωνα με το Πρόγραμμα «Καλλικράτης» μαζί με την Αίγειρο και το Αγροτικό Ορφανοτροφείο αποτελούν την τοπική κοινότητα Αιγείρου που υπάγεται στη δημοτική κοινότητα Αιγείρου του Δήμου Κομοτηνής και σύμφωνα με την απογραφή του 2011 έχει ως πληθυσμό 238 κατοίκους.
Ιστορία προσφύγων Αιγείρου και Μεσσούνης από τον ιστότοπο https://www.xronos.gr/ Μορφωτικός Πολιτιστικός Σύλλογος Μεσσούνης